從總體上看，改革開放以來，我國科技體制改革經(jīng)歷了四個階段：

第一階段，1985-1994年，是打破原有體制、推動科技服務(wù)經(jīng)濟建設(shè)的階段。1985年，中共中央發(fā)布《關(guān)于科學(xué)技術(shù)體制改革的決定》，全面啟動了科技體制改革，確定了“經(jīng)濟建設(shè)必須依靠科學(xué)技術(shù)，科學(xué)技術(shù)工作必須面向經(jīng)濟建設(shè)”的戰(zhàn)略方針，以改革撥款制度、開拓技術(shù)市場為突破口，探索科學(xué)基金制、科研課題制、同行評議制、技術(shù)合同制，創(chuàng)建科技園區(qū)，鼓勵技術(shù)入股以及科技人員創(chuàng)辦或領(lǐng)辦企業(yè)等系列重大改革舉措，引導(dǎo)科技工作面向經(jīng)濟建設(shè)主戰(zhàn)場。

這一階段科技體制改革的主要特征是配合經(jīng)濟體制改革的需要，逐步破除傳統(tǒng)計劃體制下的科技管理體制，探索形成發(fā)揮市場機制作用的新型科技體制。

第二階段，1995-2005年，是深入推動市場化改革的階段。20世紀(jì)90年代中期以后，我國確立了社會主義市場經(jīng)濟體制的改革目標(biāo)，并且初步建成社會主義市場經(jīng)濟。與之相適應(yīng)，國家根據(jù)發(fā)展形勢需要，進一步建立與市場經(jīng)濟相適應(yīng)的科技體制，作出了一系列有針對性的改革安排。1995年，中共中央、國務(wù)院作出《關(guān)于加速科學(xué)技術(shù)進步的決定》，確立“科教興國”戰(zhàn)略，提出“穩(wěn)住一頭，放開一片”的改革方針，推動科研院所分類改革。1998年，中國科學(xué)院實施知識創(chuàng)新工程試點。1999年，中共中央、國務(wù)院召開全國技術(shù)創(chuàng)新大會，部署貫徹《關(guān)于加強技術(shù)創(chuàng)新、發(fā)展高科技、實現(xiàn)產(chǎn)業(yè)化的決定》，提出構(gòu)建企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新主體、推動應(yīng)用型科研機構(gòu)企業(yè)化轉(zhuǎn)制、建設(shè)國家知識創(chuàng)新體系，以及加速科技成果轉(zhuǎn)化、大力發(fā)展科技中介服務(wù)機構(gòu)、促進科技金融及風(fēng)險投資發(fā)展等改革發(fā)展舉措。截至2003年底，共有1149個研究機構(gòu)轉(zhuǎn)制和實行分類管理。

這一階段科技體制改革的主要特征是按照市場化改革的要求繼續(xù)推進科研院所改革，逐步確立企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新主體地位，加速科技成果產(chǎn)業(yè)化，并考慮對基礎(chǔ)、公益類科研院所的穩(wěn)定支持，國家科技計劃體系逐步形成。

第三階段，2006-2015年，是深化科技體制改革、建設(shè)國家創(chuàng)新體系的階段。2006年，我國召開全國科學(xué)技術(shù)大會，發(fā)布《國家中長期科學(xué)和技術(shù)發(fā)展規(guī)劃綱要（2006-2020年）》，提出建設(shè)創(chuàng)新型國家的戰(zhàn)略目標(biāo)， 明確深化科技體制改革的目標(biāo)是推進和完善國家創(chuàng)新體系建設(shè)，從支持鼓勵企業(yè)成為技術(shù)創(chuàng)新主體、建立現(xiàn)代科研院所制度、推進科技管理體制改革以及全面推進中國特色國家創(chuàng)新體系建設(shè)等方面全面推進科技體制改革。中國特色國家創(chuàng)新體系建設(shè)重點包括五個方面：建設(shè)以企業(yè)為主體、產(chǎn)學(xué)研結(jié)合的技術(shù)創(chuàng)新體系，并將其作為全面推進國家創(chuàng)新體系建設(shè)的突破口；建設(shè)科學(xué)研究與高等教育有機結(jié)合的知識創(chuàng)新體系；建設(shè)軍民結(jié)合、寓軍于民的國防科技創(chuàng)新體系；建設(shè)各具特色和優(yōu)勢的區(qū)域創(chuàng)新體系；建設(shè)社會化、網(wǎng)絡(luò)化的科技中介服務(wù)體系。2012年，中共中央、國務(wù)院召開全國科技創(chuàng)新大會，作出《關(guān)于深化科技體制改革加快國家創(chuàng)新體系建設(shè)的決定》，提出以提高自主創(chuàng)新能力為核心，以促進科技與經(jīng)濟社會發(fā)展緊密結(jié)合為重點，進一步深化科技體制改革；提出到2020年，基本建成適應(yīng)社會主義市場經(jīng)濟體制、符合科技發(fā)展規(guī)律的中國特色國家創(chuàng)新體系，并系統(tǒng)謀劃了科技體制改革新舉措。2013年，黨的十八屆三中全會通過了《中共中央關(guān)于全面深化改革若干重大問題的決定》，提出全面深化改革的總目標(biāo)是完善和發(fā)展中國特色社會主義制度，推進國家治理體系和治理能力現(xiàn)代化，并對深化科技體制改革作了部署。

這一階段科技體制改革的主要特征是，把建設(shè)和完善國家創(chuàng)新體系作為科技體制改革的目標(biāo)，強調(diào)改革要適應(yīng)社會主義市場經(jīng)濟體制要求和科技發(fā)展規(guī)律，不僅重視對科技體制改革的“破”，而且要重視系統(tǒng)建設(shè)國家創(chuàng)新體系的“立”，對高校、科研機構(gòu)進行定位，明確建設(shè)現(xiàn)代科研院所制度的改革方向。

第四階段，2015年至今，是構(gòu)建面向創(chuàng)新驅(qū)動的新型科技體制和推進科技創(chuàng)新治理能力現(xiàn)代化的階段。2015年，中共中央辦公廳、國務(wù)院辦公廳發(fā)布實施《深化科技體制改革實施方案》，提出以構(gòu)建中國特色國家創(chuàng)新體系為目標(biāo)，全面深化科技體制改革，推進科技治理體系和治理能力現(xiàn)代化，為實現(xiàn)發(fā)展驅(qū)動力的根本轉(zhuǎn)換奠定體制基礎(chǔ)。同時提出，到2020年，基本建立適應(yīng)創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略要求、符合社會主義市場經(jīng)濟規(guī)律和科技創(chuàng)新發(fā)展規(guī)律的中國特色國家創(chuàng)新體系。圍繞建立技術(shù)創(chuàng)新市場導(dǎo)向機制，改革國家科技計劃管理，推進軍民融合創(chuàng)新體系建設(shè)，創(chuàng)建國家實驗室，改革創(chuàng)新人才培養(yǎng)及評價和激勵機制，加快科技成果使用、處置和收益管理改革，打造區(qū)域性創(chuàng)新平臺，推動大眾創(chuàng)業(yè)、萬眾創(chuàng)新等，提出了143項重大改革任務(wù)。《深化科技體制改革實施方案》標(biāo)志著我國全面推動構(gòu)建中國特色國家創(chuàng)新體系。

2015年初，國務(wù)院印發(fā)《關(guān)于深化中央財政科技計劃（專項、基金等）管理改革的方案》，啟動了我國科技計劃管理體系的改革，以改變我國科技資源配置碎片化、孤島化以及效率低等問題，推進科技創(chuàng)新治理，使科技項目資金管理更加符合科技創(chuàng)新的基本規(guī)律。2015年3月，《中共中央國務(wù)院關(guān)于深化體制機制改革加快實施創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略的若干意見》圍繞創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略的實施，從全面創(chuàng)新的角度提出深化科技體制改革的意見，目標(biāo)是到2020年，基本形成適應(yīng)創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展要求的制度環(huán)境和政策法律體系。為激發(fā)科技人員積極性，2015年10月，《促進科技成果轉(zhuǎn)化法（2015年修訂）》發(fā)布實施，推動科技成果使用權(quán)、處置權(quán)、收益權(quán)改革；2016年11月中共中央辦公廳、國務(wù)院辦公廳發(fā)布《關(guān)于實行以增加知識價值為導(dǎo)向分配政策的若干意見》，對深化科技人員收入分配制度改革進行部署。2016年5月，《國家創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略綱要》發(fā)布，提出“雙輪”驅(qū)動的戰(zhàn)略布局，即科技創(chuàng)新和體制機制創(chuàng)新兩個輪子相互協(xié)調(diào)、持續(xù)發(fā)力。體制機制創(chuàng)新要調(diào)整一切不適應(yīng)創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展的生產(chǎn)關(guān)系，統(tǒng)籌推進科技、經(jīng)濟和政府治理三方面體制機制改革，最大限度釋放創(chuàng)新活力。

此后，圍繞經(jīng)濟社會發(fā)展需求和實施創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略的要求，在科技獎勵制度、院士制度、科技評價、科研誠信等方面深入推進改革，比如2017年發(fā)布《關(guān)于深化科技獎勵制度改革的方案》，同時，院士制度改革逐步達(dá)到預(yù)定目標(biāo)，讓院士頭銜回歸本位。2018年5月，中共中央辦公廳、國務(wù)院辦公廳印發(fā)《關(guān)于進一步加強科研誠信建設(shè)的若干意見》；7月，印發(fā)《關(guān)于深化項目評審、人才評價、機構(gòu)評估改革的意見》。在打造戰(zhàn)略性科技力量上，積極構(gòu)建國家實驗室，并且積極推動科技資源共享。

總體上看，這一時期科技體制改革的主要特征是構(gòu)建與創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略實施相適應(yīng)的體制機制，在破除長期制約科技創(chuàng)新發(fā)展體制機制障礙上取得突破性進展，充分激發(fā)全社會創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)活力，在改革過程中以“立”為主，充分發(fā)揮科技創(chuàng)新在經(jīng)濟社會發(fā)展中的支撐引領(lǐng)作用，為建設(shè)世界科技強國構(gòu)建長遠(yuǎn)制度基礎(chǔ)。

綜上所述，我國科技體制改革經(jīng)歷了由被動到主動轉(zhuǎn)變的過程， 從最初的被動跟隨，按照市場經(jīng)濟要求進行體制機制改革；到強調(diào)改革要符合科技發(fā)展規(guī)律，逐步建立適應(yīng)科技發(fā)展要求的體制機制；再到黨的十八大以后，按照創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展戰(zhàn)略實施要求，加強頂層設(shè)計，主動對科技體制進行改革部署，強調(diào)發(fā)揮科技創(chuàng)新在全面創(chuàng)新中的核心作用，甚至發(fā)揮科技體制改革在全面深化改革中的突破帶動作用，改革更加系統(tǒng)，力度前所未有，措施更加有力，實現(xiàn)科技創(chuàng)新治理現(xiàn)代化、構(gòu)建適應(yīng)創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展要求的改革方向更加明確，向著既符合市場經(jīng)濟發(fā)展要求、科技創(chuàng)新基本規(guī)律，又有利于推動創(chuàng)新驅(qū)動發(fā)展的目標(biāo)穩(wěn)步推進。