中央代表團(tuán)抵達(dá)中央蘇區(qū)后，一開(kāi)始與毛澤東還相安無(wú)事，毛澤東還一度（這年10月）取代項(xiàng)英代理中共蘇區(qū)中央局書(shū)記，但不久雙方便產(chǎn)生了嚴(yán)重分歧。

1931年11月1日至5日，在中央代表團(tuán)主持下，中央蘇區(qū)黨組織在瑞金葉坪召開(kāi)第一次代表大會(huì)，即史上有名的贛南會(huì)議。會(huì)議就根據(jù)地、土地革命路線和軍事等問(wèn)題展開(kāi)了爭(zhēng)論。毛澤東堅(jiān)持認(rèn)為，中央革命根據(jù)地從實(shí)踐中形成的一整套路線和方針是正確的，是符合根據(jù)地實(shí)際情況的?！仓泄仓醒胛墨I(xiàn)研究室《毛澤東傳（1893-1949）》，中央文獻(xiàn)出版社1996年版〕但是，中央代表團(tuán)卻根據(jù)中共中央8月30日來(lái)信，強(qiáng)調(diào)中央蘇區(qū)還存在許多嚴(yán)重的錯(cuò)誤和缺點(diǎn)，其表現(xiàn)就是“缺乏明確的階級(jí)路線與充分的群眾工作”。

這次會(huì)議還根據(jù)中共臨時(shí)中央的指示，設(shè)立了中華蘇維埃共和國(guó)中央革命軍事委員會(huì)，取消紅一方面軍總司令和總政委、總前委書(shū)記的名義，毛澤東所擔(dān)任的總政委、總前委書(shū)記之職自然被免除。11月25日，中央革命軍事委員會(huì)（簡(jiǎn)稱(chēng)中革軍委）正式成立，朱德為主席，王稼祥、彭德懷為副主席，毛澤東僅為十五人組成的委員之一，只能以中華蘇維埃共和國(guó)臨時(shí)中央政府主席身份隨一方面軍總部行動(dòng)?？梢哉f(shuō)贛南會(huì)議是毛澤東在中央蘇區(qū)受排擠、打擊的開(kāi)始。

1932年4月4日，中共臨時(shí)中央政治局常委洛甫（即張聞天），在中共中央機(jī)關(guān)報(bào)《紅旗周報(bào)》發(fā)表題為《在爭(zhēng)取中國(guó)革命在一省與數(shù)省的首先勝利中中國(guó)共產(chǎn)黨內(nèi)機(jī)會(huì)主義的動(dòng)搖》的長(zhǎng)文，強(qiáng)調(diào)中國(guó)地主資產(chǎn)階級(jí)的統(tǒng)治日益走向崩潰，使中國(guó)的革命危機(jī)更加成熟，但“黨內(nèi)一部分最不堅(jiān)定的同志”，則對(duì)于目前革命形勢(shì)估計(jì)不足，“對(duì)于黨所提出的許多中心任務(wù)發(fā)生機(jī)會(huì)主義的動(dòng)搖”。（中央檔案館《中共中央文件選集》第八冊(cè)，中共中央黨校出版社1991年版）文章具體列舉了各種所謂機(jī)會(huì)主義的表現(xiàn)，并且指責(zé)“中央蘇區(qū)的同志”“表現(xiàn)出了濃厚的等待主義，等待敵人的進(jìn)攻，等待新的勝利。他們始終沒(méi)有能夠利用客觀上的順利環(huán)境去采取積極進(jìn)攻的策略。他們把'鞏固蘇區(qū)根據(jù)地'當(dāng)作符咒一樣的去念，把消滅'土圍子'當(dāng)作了鞏固根據(jù)地的中心工作，以等待敵人的新的進(jìn)攻，新的'堅(jiān)壁清野'，新'誘敵深入'與新的勝利”。“在分配土地上，中央蘇區(qū)過(guò)去提出'分配一切土地給一切人'的觀念，不用說(shuō)是十足機(jī)會(huì)主義的觀點(diǎn)”。不難看出，這里所說(shuō)的“中央蘇區(qū)的同志”，其實(shí)指的就是毛澤東。

更為嚴(yán)重的是，1932年10月，中共蘇區(qū)中央局在寧都的小源村召開(kāi)全體會(huì)議，“批評(píng)了澤東同志過(guò)去向贛東發(fā)展路線與不尊重黨領(lǐng)導(dǎo)機(jī)關(guān)與組織觀念的錯(cuò)誤，批評(píng)到前方同志對(duì)革命勝利估計(jì)不足，特別指示（出）澤東同志等待觀念的錯(cuò)誤，批評(píng)總政治部對(duì)有政治問(wèn)題的人采取了組織上自由主義與組織觀念的錯(cuò)誤，開(kāi)展了中央局從未有過(guò)的反傾向的斗爭(zhēng)”。會(huì)議“最后批準(zhǔn)毛同志暫時(shí)請(qǐng)病假，必要時(shí)到前方”。寧都會(huì)議結(jié)束后，留在寧都的中央局成員繼續(xù)開(kāi)會(huì)，研究毛澤東的去留問(wèn)題，最后作出決定：毛澤東回后方主持臨時(shí)中央政府工作，紅一方面軍總政委（1932年8月8日，中革軍委任命毛澤東擔(dān)任此職）由周恩來(lái)代理。自此，毛澤東失去了對(duì)紅軍的指揮權(quán)，實(shí)際已處于“靠邊站”的境地。

寧都會(huì)議之后，毛澤東到長(zhǎng)汀休養(yǎng)，但他在中央蘇區(qū)仍有較高的威望，中共臨時(shí)中央認(rèn)為他仍是貫徹“正確路線”的障礙。1933年2月，博古為首的中共臨時(shí)中央剛進(jìn)入中央蘇區(qū)，就開(kāi)展了所謂反“羅明路線”的斗爭(zhēng)，其用意無(wú)疑是希望通過(guò)此舉肅清毛澤東的影響。

1934年1月，中共六屆五中全會(huì)在瑞金召開(kāi)。會(huì)前，博古本想把毛澤東的中華蘇維埃共和國(guó)臨時(shí)中央政府人民委員會(huì)主席（政府總理）和中共中央政治局候補(bǔ)委員兩個(gè)職務(wù)一并取消，但由于早在中共臨時(shí)中央進(jìn)入中央蘇區(qū)之前，共產(chǎn)國(guó)際駐中國(guó)代表提出的中共中央政治局十三名委員的名單中，已將毛澤東列為第十號(hào)，所以這次會(huì)議毛澤東雖然沒(méi)有參加，但還是補(bǔ)選為政治局委員。然而，在這年1月下旬召開(kāi)的第二次全國(guó)蘇維埃代表大會(huì)（簡(jiǎn)稱(chēng)二蘇大）上，毛澤東雖繼續(xù)保留臨時(shí)中央政府中央執(zhí)行委員會(huì)主席的虛位，但他的人民委員會(huì)主席職務(wù)被張聞天取代。這就使得毛澤東不但在黨和軍隊(duì)中失去了發(fā)言權(quán)，就是政府中的那一點(diǎn)發(fā)言權(quán)，也被博古等人給剝奪了，“實(shí)際上毛澤東已被架空了”。（李維漢《回憶與思考》上，中共黨史資料出版社1986年版）

毛澤東原本對(duì)黨內(nèi)存在的“本本主義”就相當(dāng)厭惡。中央蘇區(qū)幾起幾落的人生經(jīng)歷，使毛澤東對(duì)教條主義尤為反感。1941年5月19日，毛澤東在延安高級(jí)干部會(huì)議上作《改造我們的學(xué)習(xí)》報(bào)告，曾給教條主義者畫(huà)像，說(shuō)他們是“墻上蘆葦，頭重腳輕根底淺；山間竹筍，嘴尖皮厚腹中空”，并且說(shuō)：“對(duì)于沒(méi)有科學(xué)態(tài)度的人，對(duì)于只知背誦教條的人，對(duì)于向馬列主義開(kāi)玩笑的人，你們看，像不像？如果有人真正想診治自己的毛病的話，我勸他把這副對(duì)子記下來(lái)；或者再勇敢一點(diǎn)，把它貼在自己房子里的墻壁上。”