無論采用何種醫(yī)療制度，醫(yī)療服務的供給不可避免地產生醫(yī)療成本，需要有人來承擔。醫(yī)療市場的不同主體如何承擔這一醫(yī)療成本，構成最基本的成本分攤問題。

給定免費醫(yī)療這一前提，分攤醫(yī)療成本的基本模式，可以是患者向醫(yī)院支付醫(yī)療費用，然后向第三方(如保險機構或政府)全額報銷，或由第三方直接補償醫(yī)院的運營成本。在這樣的成本分攤設計下，醫(yī)療保險機構或者政府將承擔全部的社會醫(yī)療成本，患者無需承擔任何直接的醫(yī)療費用。保險機構或者政府須為免費醫(yī)療體制籌資。如果第三方完全由商業(yè)醫(yī)療保險機構來擔當，籌資的主要來源為居民投保所繳納的保費；如果制度設計圍繞社會醫(yī)療保險機構或政府展開，則籌資的主要來源可以是保費和財政收入的組合。無論何種醫(yī)療付費機制，醫(yī)療成本都將以保費或者稅收的形式，分攤給每一個與免費醫(yī)療相關的個體，真正免費的醫(yī)療市場并不存在。

醫(yī)療費用的成本分攤模式，直接影響著醫(yī)療市場運行的公平性。確定社會醫(yī)療成本在每一個社會個體上分攤的比重時，轉移支付和交叉補貼就已經發(fā)生了。低廉甚至免費的公共醫(yī)療收費，顯著地降低了低收入群體獲取醫(yī)療資源的門檻，但其效果受保障模式和配給機制的影響。商業(yè)醫(yī)療保險注重盈利，其保費的設計往往與投保人的健康狀況緊密相關，而且存在集中選擇健康程度較好的人群，為其提供保險服務的傾向，因此并不適合作為醫(yī)療保障體系的主要模式。相比而言，社會醫(yī)療保險和稅收制度的設計，可以考慮社會不同群體收入水平，將醫(yī)療成本分攤更多地向高收入群體傾斜。由于貧困程度與衛(wèi)生條件以及健康水平往往呈現(xiàn)出負相關關系，這樣的制度安排既能提高醫(yī)療的公平性，又具有一定的收入再分配效果。不過，社會醫(yī)療保障體系在降低醫(yī)療資源使用門檻的同時，也引起資源配給和相應的公平性問題。如果公共醫(yī)療資源的使用受到諸如特權等因素主導，那么這種醫(yī)療保障體系不過是把收入差異引起的醫(yī)療不平等，轉變成權力差異下的不平等。

需要指出的是，盡管大多數(shù)國家都致力于建立并完善醫(yī)療保障體系，但真正完全免除患者醫(yī)療負擔的醫(yī)療體系并不多見。造成這種現(xiàn)象的一個重要原因是對免費醫(yī)療無效率的顧慮。受信息不對稱的影響，如果不同時對供給側和需求側的支付制度進行精心安排，就很容易造成道德風險下的效率損失。過度醫(yī)療是這種道德風險的最常見表現(xiàn)。