思想庫是以公共政策為研究對象，以影響政府決策為目標，以公共利益為研究導向，以社會責任為研究準則的專業(yè)研究機構(gòu)。獨立性是思想庫的重要特征，包括運用開放性思維對事實進行客觀分析的思想獨立，不以營利為目的、研究不受資金來源影響的經(jīng)濟獨立。獨立性構(gòu)成了思想庫權威可信的基礎。但這是否意味著思想庫應堅持中性立場、摒棄意識形態(tài)呢？

探究思想庫與意識形態(tài)的關系可以從思想庫最為繁盛的美國開始。美國思想庫多達1800多家，頂級思想庫不勝枚舉。排名全球第一的美國布魯金斯學會素有“民主黨的影子內(nèi)閣”之稱，強調(diào)社會福利，提倡政府干預社會和經(jīng)濟事務，支持溫和、寬容的對外政策，與美國經(jīng)濟政策研究所同為自由派智庫的代表；美國傳統(tǒng)基金會則與企業(yè)研究所、胡佛研究所等同為共和黨的智囊機構(gòu)，贊成市場經(jīng)濟，反對政府管制經(jīng)濟，主張強硬的外交政策，被譽為保守派的“忠實代理人”。英國智庫也具有明顯的黨派標識，費邊社、青年費邊人、公共政策研究會是左派智庫的典型，亞當·史密斯研究所、政策研究中心則是右派智庫的典范。德、法、日、韓等國的著名智庫也都與政黨緊密相連，具有明顯的黨派傾向。由此可見，獨立與中性是相對的，思想庫也需要意識形態(tài)的旗幟。無論“左右之爭”還是“自由與保守之爭”，都是不同意識形態(tài)的表達。

思想庫植根于政治、經(jīng)濟、文化的土壤，誕生之時就帶有意識形態(tài)的方向感。中國古代思想庫發(fā)端于戰(zhàn)國時期的稷下學宮。作為齊國君主設立的學術兼政治咨詢中心，稷下學宮成為戰(zhàn)國中后期直至以后各種思想流派、執(zhí)政主張發(fā)展的源頭，如漢初統(tǒng)治者奉為圭臬的黃老之學，統(tǒng)治中國幾千年的儒學，以及道、法、墨、名、陰陽五行、縱橫之術，無不帶有鮮明的政治傾向性。

現(xiàn)代思想庫意識形態(tài)的色彩更為濃厚。內(nèi)政方面表現(xiàn)為黨派間鮮明的政治主張。美國思想庫歷來宣稱自身的“非營利性、獨立性和無黨派”，事實上其影響力直達美國政治核心，是政府決策過程必不可少的重要環(huán)節(jié)。美國傳統(tǒng)基金會會長愛得溫·福爾納曾直言不諱，“我們的作用是努力影響華盛頓的公共政策圈子——首先是國會，其次是行政部門，第三是全國性媒體”。最能體現(xiàn)美國思想庫與政界密不可分的就是“旋轉(zhuǎn)門”機制，即學者和官員之間的互相流通。以布魯金斯學會為例，現(xiàn)任的研究員中半數(shù)以上具有政府工作背景，而學會中加入奧巴馬政府的就有超過30人之多。