農業(yè)發(fā)展制度改革：以保護農民利益為導向。要建立農業(yè)可持續(xù)發(fā)展機制，以保障國家的糧食安全這樣一個重大的戰(zhàn)略，前提是保證農民能夠持續(xù)從農業(yè)發(fā)展中得到比較收益，而確保農業(yè)持續(xù)發(fā)展無非是靠農產品市場價格的激勵作用和政府財政投入的導向作用。近年來，由于農業(yè)生產的成本隨著生產資料價格和農村勞動力價格的上漲而大幅上升，如農村勞動力價格比城市勞動力價格還要高。在鄉(xiāng)村調研時，農民反映人工的成本太高了，種田的農活要互相換工，才能降低成本。因此，無疑會使國家的財政政策效應偏離政策預期。而同時，政府的農業(yè)財政補貼再高，也無法超越農產品市場價格的實質效益。健全農業(yè)的支持保護制度，一方面，政府財政投入的導向作用要通過農產品市場價格的原動力起作用；另一方面，農產品市場價格的激勵作用需要政府財政投入的推動力來激發(fā)。農產品市場價格的激勵作用需要政府的全方位制度體系建構才能走得更遠，而政府的制度體系建構必須通過農產品市場價格的激勵作用才能可持續(xù)發(fā)展。搞市場經濟不按市場經濟規(guī)則行事，一旦豬肉上漲了政府就開會發(fā)布文件如何壓價，一旦豬肉下跌就發(fā)布文件全面扶持。把農業(yè)的資源配置排除在市場之外，就必然引發(fā)很多問題。

城鄉(xiāng)一體化體制機制改革：以發(fā)展共享為目標。城鄉(xiāng)一體化就是要求城鄉(xiāng)經濟權利、政治權利的平等，給農民一個平等的國民待遇。在經濟發(fā)展方面，最重要的是城鄉(xiāng)平等交換的權利，比如土地就要禁止政府強行征訂，農產品價格和農業(yè)資源要為市場所決定。另一個就是公共產品城鄉(xiāng)平等享受的權利，不分種族、不分性別、不分職業(yè)，城鄉(xiāng)每個人均有權利平等享受。比如農村修路大都要農民集資，城里哪有集資修路的？電力是商品，農民卻要集資辦電。很多“惠民工程”，都要鄉(xiāng)村配套，都要基層配套。最后誰來配套呢？鄉(xiāng)、村大多沒有財政能力，最后都是農民來出錢，而同樣的建設在城市都是政府出錢。所以，農民之所以是弱勢群體，不僅僅是因為農業(yè)比較效益低，而且農民的養(yǎng)老等各種社會保障得不到公共財政的覆蓋，使農村勞動力在市場中遭受了不公平待遇。農村勞動力參與市場競爭沒有社會保障，什么都要自己負責。只有破除這個城鄉(xiāng)二元體制機制，在推進城鄉(xiāng)要素平等交換和公共資源均衡配置取得重大突破，才能讓農民能夠共享發(fā)展成果；也只有共享發(fā)展才能充分發(fā)揮農民的主體作用和首創(chuàng)精神，才能夠不斷激發(fā)農村的發(fā)展活力。

農村社會治理改革：以村民自治創(chuàng)新為突破。中國過去幾千年的農村社會治理都是鄉(xiāng)紳制度，這樣的鄉(xiāng)村治理使中華民族幾千年的文明沒有斷代。但那時是一個農耕社會，處于封閉的自然經濟狀態(tài)，而現(xiàn)在是一個全球化、信息化的時代?？梢哉f，我們身處的這個時代是三個時代的時空并存：不少落后地區(qū)處于農耕時代，正處于為擺脫貧困而發(fā)展的進程中；很多地方進入了工業(yè)時代，正在加快推進城鎮(zhèn)化進程；一些發(fā)達地區(qū)已經進入了信息化時代，如北、上、廣地區(qū)絕對不落后于西方發(fā)達國家的城市。西方發(fā)達國家從農耕時代進入工業(yè)時代、再進入信息化時代是逐漸演進的，而我們有幸處于三個時代并存，這是人類史上絕無僅有的發(fā)展史。作為全球的人口大國，大規(guī)模、快速度的城鎮(zhèn)化、現(xiàn)代化，無疑會發(fā)生傳統(tǒng)與現(xiàn)代、制度與現(xiàn)實、城市與鄉(xiāng)村等方面的激烈碰撞，有很多制度性的建構不可能一刀切。村民自治就是要體現(xiàn)差異性，因為每個村都是不一樣。怎么實現(xiàn)鄉(xiāng)村治理的創(chuàng)新？需要在政治文明建設的大格局中來推進，來放開、放活鄉(xiāng)村基層民主，創(chuàng)新村民自治的有效實現(xiàn)形式。推進農村社會治理改革，實現(xiàn)政經分開，實質上就是要求在新的歷史轉折點上，探索農村改革從偏重于生產力發(fā)展到同時促進上層建筑完善等方面實現(xiàn)根本性轉變的有效途徑，使農村基層組織在新一輪改革中順利實現(xiàn)變革和新生。