另外，凡日朝，六科輪一人立殿左右，拿筆記旨。凡題奏，日附科籍，五日一送內(nèi)閣，備編纂。其諸司奉旨處分事目，五日一注銷，覈稽緩。內(nèi)官傳旨必覆奏，復(fù)得旨而后行。鄉(xiāng)試充考試官，會(huì)試充同考官，殿試充受卷官。冊(cè)封宗室、諸蕃或告諭外國，充正、副使。朝參門籍，六科流掌之。登聞鼓樓，日一人，皆錦衣衛(wèi)官監(jiān)蒞。受牒，則具題本封上。遇決囚，有投牒論冤者，則判停刑請(qǐng)旨。凡大事廷議，大臣廷推，大獄廷鞫，六科都給事中皆參預(yù)。

六科給事中的創(chuàng)置，對(duì)于地位和職權(quán)都已提高了的六部，起著箝制的作用，同時(shí)也分解了都察院的監(jiān)察權(quán)。都察院和六科之間有一定分工，但并不絕對(duì)。給事中同御史之間，亦可互相糾劾。

明代的司法機(jī)關(guān)較前代也有了進(jìn)一步的擴(kuò)展，其中央司法機(jī)關(guān)是刑部、大理寺和擁有一定司法權(quán)的都察院。與前代不同，明代刑部掌審判，大理寺則一般不再掌管審判，而專掌復(fù)核。因?qū)徟袣w刑部，事務(wù)性工作大增，因而刑部規(guī)模也相應(yīng)擴(kuò)大，由前代的四司擴(kuò)充為十三清吏司，分別受理地方上訴案件，以及審核地方上的要案和審理中央百官的案件。明代對(duì)罪犯的處罰分死、流、苔、刑、徙幾等，刑部有權(quán)處理流刑以下案件，但定罪以后，須將罪犯連同案卷送大理寺復(fù)核。死刑案件必須奏請(qǐng)皇帝批準(zhǔn)。刑部的審判和大理寺的復(fù)核均須接受都察院的監(jiān)督。

大理寺為明代中央司法復(fù)審機(jī)關(guān)，設(shè)有大理寺卿一人，左、右少卿各一人，左、右寺丞各一人。所屬有司務(wù)廳和左、右二寺。大理寺卿掌審讞平反刑獄之政令，少卿、寺丞協(xié)助之。左、右寺分理京畿，十三布政司刑名之事。凡刑部、都察院、五軍斷事官所審理的獄訟，都必須"移案牘，引囚徒，詣寺詳讞"，①分別由左、右寺寺正根據(jù)各自所轄而進(jìn)行復(fù)審。"既按律例，必復(fù)問其款狀，情允罪服，始呈堂準(zhǔn)擬具奏。不則駁令改擬，曰照駁。三擬不當(dāng)，則糾問官，曰參駁。有牾律失入者，調(diào)他司再訊，曰番異。猶不愜，則請(qǐng)下九卿會(huì)訊，曰圓審。已評(píng)允而招由未明，移再訊，曰追駁。屢駁不合，則請(qǐng)旨發(fā)落，曰制決。"案件審理完畢，凡未經(jīng)大理寺復(fù)核者，諸司對(duì)罪犯均不得擅自發(fā)遣，否則即追究責(zé)任。

為保證案件審理無誤，明代中央還建立了"三法司"聯(lián)合審判制度。三法司即指刑部、大理寺、都察院。凡遇有大獄重囚，均由三法司聯(lián)合審理，稱"三堂會(huì)審"。

地方司法機(jī)構(gòu)，府、縣一級(jí)仍與行政機(jī)關(guān)結(jié)合在一起，由知府、知縣等地方行政最高長官掌握轄區(qū)司法審判工作。省級(jí)則專設(shè)司法機(jī)關(guān)--提刑按察使司。按察使有權(quán)處理徙以下案件，徙以上重案就必須報(bào)送中央刑部審理。從司法審判系統(tǒng)看，明朝自縣、府、省以至中央刑部、三法司，形成了一套完整的體系，最高司法則仍屬皇帝。

①《明史·職官二》。

此外，明朝特設(shè)的"廠"、"衛(wèi)"特務(wù)組織，雖然不是正式的司法機(jī)構(gòu)，但也被皇帝特令兼管刑獄，賦予巡察偵緝，專理詔獄和審訊的權(quán)力。特務(wù)司法是明代司法獨(dú)具的特點(diǎn)。