陳云一貫堅(jiān)持實(shí)事求是的思想原則，主張秉筆直書，根據(jù)當(dāng)時(shí)的客觀環(huán)境去分析、判斷和評(píng)價(jià)黨史人物的功過是非。粉碎“四人幫”以來，陳云在不同場合對(duì)周恩來、劉少奇、李先念、薄一波等黨的領(lǐng)導(dǎo)人的杰出貢獻(xiàn)做過符合實(shí)際的評(píng)價(jià)，對(duì)林彪、“四人幫”、康生等黨史上的反面人物也作出了準(zhǔn)確的評(píng)判。

為劉少奇等一系列冤假錯(cuò)案平反

早在中紀(jì)委成立前，陳云就提出：一定要堅(jiān)持“有錯(cuò)必糾”的方針，解決“文革”中的問題和歷史上的遺留問題。中紀(jì)委成立后，陳云親自領(lǐng)導(dǎo)解決了新中國成立后第一大冤案——劉少奇冤案的平反工作，并對(duì)劉少奇的功績做了公正的評(píng)價(jià)。1978年12月，陳云在家中親切會(huì)見王光美及其子女。陳云明確指出，劉少奇的冤案，不是一個(gè)人的事情，“是黨和國家的事情。他的這個(gè)案子是要平反的”。

陳云積極催促有關(guān)部門復(fù)查劉少奇案件，1979年2月23日，陳云批示：“中央辦公廳應(yīng)正式通知中組部、中紀(jì)委合作查清劉少奇一案。”1979年3月6日，他在會(huì)見外賓時(shí)說：“專案材料說劉少奇1929年在沈陽擔(dān)任滿洲省委書記時(shí)被捕后，組織被破壞，供出一些人，沒有那么回事，不是事實(shí)。”“劉少奇出來后，還向中央作過報(bào)告，黨組織并沒有被破壞。”

在陳云的積極推動(dòng)下，中紀(jì)委與中組部共同成立了劉少奇案件復(fù)查組，對(duì)劉少奇一案進(jìn)行了認(rèn)真細(xì)致的復(fù)查。經(jīng)過一年時(shí)間，逐項(xiàng)調(diào)查核實(shí)和駁斥了原來扣在劉少奇頭上的“叛徒”“內(nèi)奸”“工賊”等罪名，向中央作出了實(shí)事求是的復(fù)查報(bào)告。據(jù)此，中共十一屆五中全會(huì)決定：撤銷八屆十二中全會(huì)作出的決議，為劉少奇徹底平反昭雪，恢復(fù)名譽(yù)，同時(shí)對(duì)受牽連的人和事，凡屬冤假錯(cuò)案的一律平反。

除劉少奇外，陳云還實(shí)事求是地評(píng)價(jià)了陶鑄、王鶴壽、彭德懷、薄一波等同志為黨的事業(yè)作出的貢獻(xiàn)，使一批黨的優(yōu)秀干部得以平反。

在1978年11月中共中央召開的工作會(huì)議上，陳云作了一個(gè)有重要?dú)v史意義的發(fā)言，他在會(huì)議東北組的發(fā)言中首先提出了“文革”中制造的所謂薄一波等61人叛徒集團(tuán)一案，他實(shí)事求是地證明：“他們出反省院是黨組織和中央決定的，不是叛徒。1937年7月7日中央組織部關(guān)于所謂自首分子的決定這個(gè)文件，是我在延安任中央組織部長以前作出的，與處理薄一波同志等問題的精神是一致的。……在1941年也寫過一個(gè)關(guān)于從反省院出來履行過出獄手續(xù)，但繼續(xù)干革命的那些同志，經(jīng)過審查可給以恢復(fù)黨籍的決定。這個(gè)決定與‘七七決定’精神是一致的。這個(gè)決定也是中央批準(zhǔn)的。”他明確主張：對(duì)于那些在“文化大革命”中被錯(cuò)誤定為叛徒的同志應(yīng)給以復(fù)查，如果并未發(fā)現(xiàn)有新的真憑實(shí)據(jù)的叛黨行為，應(yīng)該恢復(fù)他們的黨籍?？谷諔?zhàn)爭時(shí)期和解放戰(zhàn)爭時(shí)期當(dāng)時(shí)由黨組織決定在敵偽政權(quán)中任職，掩護(hù)我黨我軍的工作，這些黨員在“文化大革命”中被定為叛徒的，也應(yīng)復(fù)查，對(duì)并無背叛行為的同志應(yīng)恢復(fù)黨籍。

陳云還對(duì)“文革”中和“文革”前遭受冤屈的黨和軍隊(duì)的卓越領(lǐng)導(dǎo)人瞿秋白、張聞天、蕭勁光等做出過正確客觀的評(píng)價(jià)，幫助他們平反昭雪。對(duì)于瞿秋白在獄中寫了《多余的話》，陳云認(rèn)為，看人要看主流，看全面，他無非就是寫了個(gè)《多余的話》，有消極的東西，但臨死前還高喊口號(hào)“共產(chǎn)主義萬歲”“共產(chǎn)黨萬歲”。在八七會(huì)議上，他是反對(duì)陳獨(dú)秀的，他的“左”傾錯(cuò)誤路線時(shí)間不過半年。在張聞天夫人劉英要求給張聞天做政治結(jié)論的信上，陳云批示“完全應(yīng)該”，并親自主持了張聞天的追悼會(huì)。對(duì)加在蕭勁光頭上的不實(shí)之詞，陳云曾致信鄧小平：“蕭勁光平反不要留尾巴。”“蕭勁光是受‘四人幫’迫害的。”他還親自給蕭勁光文集提寫了“一代元戎”的書名，反映了他對(duì)蕭勁光歷史功績的充分肯定。