二、抗擊新冠肺炎疫情面臨的重要挑戰(zhàn)
抗擊新冠肺炎疫情面臨的重要挑戰(zhàn)主要有兩個方面。
第一,做好鑒別診斷。新冠病毒感染者的臨床癥狀與甲流、乙流以及其他呼吸道感染的臨床癥狀很相似,但是對這些疾病的治療方法卻有所不同。因此,我們要做好鑒別診斷,識別出到底是哪種病毒。
第二,一些新冠病毒感染者,在感染新冠病毒的同時,可能還有其他疾病,這就會使他們的癥狀加重。因此,我們要做好合并感染診斷,進行有針對性的個體化治療。
當(dāng)前,我國在新冠肺炎疫情防控上已經(jīng)取得了一定成效,重點是嚴防境外輸入。
三、如何進行新冠病毒檢測
我國現(xiàn)在有基于基因擴增和針對抗體的單指標試劑盒,這些試劑盒只能檢測新冠病毒這個單一指標;同時也開發(fā)了多病毒檢測的技術(shù)和產(chǎn)品。前面我們講到,檢測病毒可以進行核酸檢測和抗體檢測,這兩種方法涉及兩大類技術(shù):一類是分子檢測技術(shù),另一類是免疫學(xué)檢測技術(shù)。分子檢測,檢測的對象是針對病原體本身,也就是鑒定病原體本身的核酸;免疫學(xué)檢測,相對來說是間接診斷,當(dāng)病原體侵襲人體后,人體免疫系統(tǒng)會產(chǎn)生抗體,因此通過檢測抗體就可以知道人體感染了哪種病毒。
分子檢測和免疫學(xué)檢測兩種方法也有不同的特點。分子檢測供臨床使用的試劑盒,一般會在幾小時之內(nèi)得出結(jié)果,它基于兩大類技術(shù):一類是PCR技術(shù),另一類是基于恒溫擴增的微流控芯片技術(shù)。在拿到樣品后,使用PCR試劑盒大約2.5-3小時可以得到結(jié)果;使用微流控的恒溫擴增產(chǎn)品,大約在1.5小時之內(nèi)就可以得到結(jié)果?,F(xiàn)在已經(jīng)批準的PCR試劑盒是針對單一指標的,而芯片產(chǎn)品可以檢測多種常見病毒和細菌,通過高通量測序使檢測范圍更廣。
下面,我向大家匯報和分享一下針對多種病原體核酸檢測的芯片技術(shù)和產(chǎn)品。
(圖1)
上圖(圖1)可以看到,這是一個塑料芯片,我們在對樣品(痰液或者咽拭子)進行處理后,提取其中的核酸,加上其他試劑,放進芯片的一個小孔內(nèi),芯片外邊的一圈里面有相應(yīng)的試劑,這些試劑可以跟樣品反應(yīng),通過反應(yīng)檢測出相應(yīng)的病毒。這個芯片可以檢測出6種呼吸道核酸病毒,我們可以通過它進行鑒別診斷和合并感染診斷。
那么,我們是怎樣通過這張芯片得知檢測結(jié)果的?分子檢測技術(shù)可以通過生物技術(shù)對病毒進行擴增。為什么要擴增?當(dāng)病毒很少時,我們是檢測不到的,所以要通過生物技術(shù)讓病毒復(fù)制足夠的量。當(dāng)病毒復(fù)制到足夠量的時候,我們還需要進行相應(yīng)的標記。什么是標記?就是相當(dāng)于給要檢測的分子帶上一個“燈籠”,通過相應(yīng)的設(shè)備可以檢測到這個“燈籠”,這樣我們就能夠間接地知道是哪種病毒了。
(圖2)
(圖3)
這張芯片需要放到機器里進行檢測。不同的醫(yī)療機構(gòu),可以選用不同型號的機器。上面這臺機器(圖2)是單通道的,機器中有一個托盤,像電腦的光盤倉一樣,可以讓芯片進入。芯片進入機器后會一邊旋轉(zhuǎn)一邊做擴增反應(yīng),在擴增的過程中熒光分子會標記核酸所帶的“燈籠”,機器中相應(yīng)的光學(xué)器件會檢測到熒光分子,這一程序是自動的,我們在電腦上就能看到結(jié)果。從2016年開始,這款機器已經(jīng)在全國360多家醫(yī)院得到了很好的應(yīng)用。后來有的醫(yī)院跟我們講,由于醫(yī)院病人較多,他們需要更高通量的機器,因此我們又開發(fā)了下面這款機器(圖3),這款機器像“魔方”一樣,一層有四個“窗口”,“窗口”里的托盤出來以后,可以把芯片放進去,這樣一套機器可以同時檢測16個樣本。
前面我們講到,這張芯片可以檢測6種病毒,包括新型冠狀病毒、甲流、乙流等,它的檢測原理是基于生物技術(shù)產(chǎn)生擴增。常規(guī)的PCR技術(shù)也是一種擴增技術(shù),但是它需要三個溫度區(qū)進行循環(huán),由于需要對儀器設(shè)備進行溫度區(qū)的切換,整體的擴增時間就要長一些。上面這兩種儀器(圖2、圖3)用到的是恒溫擴增技術(shù),反應(yīng)時間比PCR技術(shù)更快一些,一般在45分鐘之內(nèi)就可以完成。加上樣品放入芯片之前,提取核酸再與其他試劑混合需要的30分鐘,整個核酸檢測一般在1.5小時以內(nèi)就能完成。
總的來看,上面這款芯片系統(tǒng),一方面檢測較快,全程只需1.5小時;另一方面,還具有檢測多指標的優(yōu)勢,可以同時檢測6種呼吸道病毒,它可以做鑒別診斷以及合并感染診斷。
怎樣看到檢測結(jié)果?我們已經(jīng)設(shè)計好了自動化報告系統(tǒng)的軟件,機器旁邊的電腦上會呈現(xiàn)出實時曲線,軟件會自動給出這幾種病毒指標是陽性還是陰性,不需要再做人為的統(tǒng)計。從芯片到儀器,都是擁有國家自主知識產(chǎn)權(quán)的。
多病毒檢測芯片和PCR試劑盒都是基于核酸檢測分子診斷的方法。免疫學(xué)檢測需要在發(fā)病三天或者感染七天后才能檢測出相應(yīng)的抗體。當(dāng)然,免疫診斷試劑和核酸診斷試劑可以互相補充進行診斷。
2020年2月末,清華大學(xué)向武漢捐贈了1.2萬份檢測芯片,為各個醫(yī)院做鑒別診斷和合并感染診斷做出了應(yīng)有貢獻。未來,通過全集成技術(shù)對芯片進行進一步升級后,就不用在芯片之外再提取核酸了,從而進一步縮短提取核酸所需的30多分鐘時間,或是將它合并到檢測過程中,就不用人為操作了,以此降低操作人員的風(fēng)險。這種芯片很快就會被研發(fā)出來并進入臨床,也就是將樣品放入芯片后,所有的操作都由芯片和機器自動完成,大約1小時就可以得出最終結(jié)果。
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