自2011年新一輪事業(yè)單位改革啟動以來，我國事業(yè)單位體制改革開始進(jìn)入一個全新的歷史階段。特別是2014年以來，我國事業(yè)單位體制改革取得諸多積極成果和明顯進(jìn)展。

截至2012年8月，中央編辦對外正式宣布，我國事業(yè)單位清理規(guī)范工作已經(jīng)在全國范圍內(nèi)基本完成。從2011年到2015年，我國將在清理規(guī)范基礎(chǔ)上完成事業(yè)單位的分類認(rèn)定。相關(guān)報道顯示，截至2013年11月，中央和國務(wù)院部門所屬事業(yè)單位的分類認(rèn)定工作絕大部分已經(jīng)完成。

但我國事業(yè)單位改革仍存在很多問題，主要表現(xiàn)在：

（一） 改革總體滯后，動力仍不足，阻力仍然巨大

1、改革難度大，總體進(jìn)展緩慢

事業(yè)單位改革是一場廣泛而深刻的革命，其難度不亞于國有企業(yè)改革，也不亞于政府機(jī)構(gòu)改革。在這場改革中，政府部門既是推動者，又是改革對象，改革中的“主客同體”現(xiàn)象使其陷入尷尬境地。某種程度上，事業(yè)單位改革實質(zhì)上首先是政府自身的改革。

同時，應(yīng)當(dāng)看到，事業(yè)單位改革是我國經(jīng)濟(jì)社會政治發(fā)展到今天的形勢所決定的，由此引發(fā)的矛盾太多，不改走不下去；事業(yè)單位矛盾已經(jīng)成為社會矛盾的一部分，社會不公平感加劇，這對整個社會的和諧是一個威脅，也增加了事業(yè)單位改革的難度和敏感度。這從事業(yè)單位養(yǎng)老金制度改革可見一斑。而改革進(jìn)展的緩慢與社會公共服務(wù)需求全面快速增長形成較大反差和差距。

2、改革動力不足，阻力仍較大

事業(yè)單位的既得利益對改革仍抱有遲疑和觀望態(tài)度。從利益相關(guān)者角度，可對事業(yè)單位改革的阻力做出具體分析。根據(jù)一項2012-2013全國部分省市問卷調(diào)查：對政府部門而言，事業(yè)單位改革最大阻力來源是“擔(dān)心改革引發(fā)不穩(wěn)定”，其次是“部門利益”。對事業(yè)單位領(lǐng)導(dǎo)而言，“自身利益”成為第一阻力，特別是原有的領(lǐng)導(dǎo)身份、行政級別、待遇將失去或被降低，其次是“擔(dān)心改革引發(fā)不穩(wěn)定”；對事業(yè)單位職工而言，“改革影響切實利益“位列第一阻力來源，“不知該后情況是好是壞”位列第二；從社會大環(huán)境而言，“社會保障體系不健全”是制約改革推進(jìn)的最大因素。總體來看，各方改革意愿不高，不愿改，不想改，還較為普遍。

（二） 政事一體化體制未獲實質(zhì)突破，導(dǎo)致行政化色彩仍較濃

1、政事不分、管辦不分現(xiàn)象仍較為嚴(yán)重

從某種意義上講，“官本位思想”是事業(yè)單位體制改革的最大障礙。長期以來，在我國，事業(yè)單位構(gòu)成了行政體制系統(tǒng)的重要部分。迄今為止，從總體上來看，事業(yè)單位系統(tǒng)尚未擺脫計劃經(jīng)濟(jì)時期形成的管理體制框架。事業(yè)單位的核心特征：國家人員性質(zhì)、財政供養(yǎng)、國家統(tǒng)一確定級別待遇等依然沿用至今。由于事業(yè)單位的各項管理制度都是參照黨政機(jī)關(guān)，事實上成為黨政機(jī)關(guān)附屬機(jī)構(gòu)，因而在治理機(jī)構(gòu)上二者大體一致，并表現(xiàn)為“政事不分”。正是這種政事不分的一體化體制催生了事業(yè)單位的“行政化”傾向，并衍生了諸如權(quán)責(zé)不清、效率低下、人浮于事、資源耗空、衙門習(xí)氣等諸多弊端。

2、法人治理結(jié)構(gòu)不健全，功能作用未能有效發(fā)揮

在事業(yè)單位分類改革中，雖然各類事業(yè)單位探索建立了多種形式的法人治理結(jié)構(gòu)，但普遍存在的法人權(quán)力無法落實、功能作用不能有效發(fā)揮的問題。其基本表現(xiàn)就是，大多數(shù)事業(yè)單位在人、財、物等方面沒有完全獨(dú)立的決策權(quán)，其法人決策權(quán)是不完整的。以國家食品安全風(fēng)險評估中心為例，該單位采用理事會決策監(jiān)督管理模式的公共衛(wèi)生事業(yè)單位，舉辦單位是國家衛(wèi)計委。理事會由23人組成，其中設(shè)理事長1名，副理事長2名。理事長由于國家衛(wèi)計委分管領(lǐng)導(dǎo)擔(dān)任，副理事長分別有國務(wù)院食安辦、農(nóng)業(yè)部分管領(lǐng)導(dǎo)擔(dān)任，理事由相關(guān)行政部門代表、食品安全相關(guān)領(lǐng)域?qū)＜?、中心管理層和服?wù)對象代表等人員組成，成為“人大”，但實際運(yùn)作中很難發(fā)揮“決策”作用，更多發(fā)揮的是議事咨詢作用，更像是“政協(xié)”。

3、監(jiān)管體制不健全，事業(yè)腐敗現(xiàn)象時有發(fā)生

在“政事一體，管辦不分”體制背景下，行政主管部門與事業(yè)單位之間存在緊密項相連又權(quán)責(zé)模糊的利益關(guān)聯(lián)。由于行政主管部門既是裁判員，又是教練員，使得正真客觀公正的監(jiān)管難以實現(xiàn)，從而也很難保證公共服務(wù)供給的公平性。這中監(jiān)管體制虛化的背景下，事業(yè)單位腐敗問題就會發(fā)生，并集中體現(xiàn)在：硬件基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)中的“暗箱操作”，財務(wù)管理領(lǐng)域的“小金庫”、人事任免領(lǐng)域和學(xué)術(shù)會議管理領(lǐng)域等。近年來，醫(yī)療藥品、學(xué)校招生、科研經(jīng)費(fèi)等領(lǐng)域案腐敗頻發(fā)就引起了社會關(guān)注。

（三）改革主要靠政策推動，缺乏足夠的法治保障

1、立法層次較低

迄今為止，關(guān)于事業(yè)單位改革的相關(guān)制度方案，主要以各級政策文件和部門規(guī)章為主，僅有少量的行政法規(guī)，例如：《事業(yè)單位登記暫行管理條例》（1998,2004）和《事業(yè)單位人事管理條例》（2014），但尚缺乏基本法律層面的制度供給和保障。這種制度供給現(xiàn)狀與事業(yè)單位改革的迫切性、艱巨性和復(fù)雜性不相匹配。顯然，僅僅依靠政策推動事業(yè)單位改革是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的，無論是改革過程的推進(jìn)還是改革成果的保障，都離不開法治保障。

2、立法空白不少

“事業(yè)單位”是中國特有的一種概念現(xiàn)象和組織形式。我國現(xiàn)行法律中針對事業(yè)單位的性質(zhì)和職能未能清晰界定。特別是，針對分類改革后的事業(yè)單位，面臨嚴(yán)重的法律缺失和不足問題。例如，針對事業(yè)單位轉(zhuǎn)制為“企業(yè)”，現(xiàn)行做法多是參照和比照國企改制的相關(guān)政策法規(guī)和做法，這就容易留下法律隱患；針對事業(yè)單位轉(zhuǎn)制為“公益機(jī)構(gòu)”，法律的適用更是面臨空白，改革處于無法可依的困境。針對事業(yè)單位法人制度，相關(guān)法律法規(guī)也不完善，且立法內(nèi)容簡略，甚至缺失，例如尚沒有關(guān)于法人破產(chǎn)的規(guī)定，而且針對法人設(shè)立條件的規(guī)定也過于模糊等。